Le Poste de Commandement de la troisième Légion de Gendarmerie est basé à Ouagadougou avec compétence sur les régions administratives du centre, du plateau central, du centre-sud et du centre-ouest.
Elle est structurée de la manière suivante :
- Un Etat Major implanté à Ouagadougou ;
- Deux (02) Groupements de Gendarmerie Départementale à savoir celui de Ouagadougou et celui de Koudougou.
- Un Groupement de Gendarmerie Mobile composé des 31ème 33ème et 36ème EGM, tous basés à Ouagadougou.
- Un (01) Groupement de Transport Aérien avec un Escadron de Sécurité Aéroportuaire.
- Une Section de Recherches comprenant quatre (04) cellules dont : la cellule criminelle, la cellule stupéfiants et mœurs, la cellule police technique, la cellule économique et financière.
- La Troisième région de Gendarmerie compte quatre (04) Compagnies de Gendarmerie. Elles sont sous l’autorité des Commandants de Groupements et chargées du contrôle des sous-unités de Gendarmerie. Les compagnies de région sont :
- Compagnie Ouaga : 08 sous-unités
- Compagnie Kadiogo : 07 sous unités
- Compagnie Aéroport : 01 sous-unité
- Compagnie Ziniaré : 08 sous-unités
- Compagnie Manga : 06 sous-unités
- Compagnie Pô : 06 sous-unités
- Compagnie Léo : 06 sous-unités
- Compagnie Réo : 06 sous-unités
- Compagnie Koudougou : 09 sous-unités
Depuis sa création, la Troisième Légion de Gendarmerie a été successivement commandée par :
- Feu Colonel SAWADOGO Laurent de 1995 à 1999 ;
- Le Colonel FOROGO Labawo de 1999 à 2007 ;
- Le Colonel BAMBARA Hermann M.O de 2007 à 2008 ;
- Le Colonel COULIBALY Tuandaba de 2008 à 2011 ;
- Le Colonel OUEDRAOGO Serge Alain de 2011 à 2017 ;
- Le Colonel OUEDRAOGO Z. Blaise de 2017 à 2021 ;
- Le Lieutenant-Colonel DIABRI Léoni Rakiswendé à partir du 16 décembre 2021.